惲氏始祖諱子冬字貞道，生于漢永光辛巳(公元前40年)，卒于漢建武戊子(公元28年)八月八日，漢平帝時為梁王左相，因不合而隱處毗陵之千秋鄉(今常州新北區孟河鎮)，卒后葬于常州江邊黃山之麓而建祠于嶺。貞道公生平事跡及生卒葬俱載漢司空東武伏恭志銘中，“其文簡宕，非漢以后人語”。譜亦載，貞道公“葬黃山之南谷穴，巳亥偏向建祠于山”。故事實應該確信無疑。長江南岸有長蒲 并上灘田，使族之子孫能世世奉祀。隨著時間的遷移，祠廟逐步變成了佛寺，至明朝，惲氏五十六世孫東麓公諱巍為雪江處士亦作了詳細記載，至明末清初，由于朝代更替，祠廟遭到破壞，祠田亦已喪失。

　　惲氏自貞道公傳至四十四世為宋提舉方直公，方直公生子二，長紹恩世居孟城(即河莊)為惲氏北分之祖，次繼恩別業徙居升西鄉(即上店)為惲氏南分之祖。至順治十一年甲午(1654年)，惲氏南北子孫看到自己祖先的祠廟被毀感到非常痛心， 六十一世孫炌及本初等一十八人協力，首先恢復了灘田，又經過二十年至康熙十二年癸丑(1673年)，紹謙公、如斌公等倡議，通族捐價公置孟河城中廳房一所重建專祠，此廳房原為膴原公之舊宅。膴原公諱厥初，惲氏六十一世孫，明萬歷甲辰(1604年)進士，授行人司行人，歷任陜西布政使，升光祿寺卿。膴原公受之敬于公，而匪庵公為創捐者。當時北分合捐銀六百二十兩，南分匪庵公捐價銀六百三十兩，共耗銀一仟二佰五十兩，建造惲氏大宗祠六重，每重五楹，祠基達五畝四分，祠田達近百畝：有設字號長蒲 田56畝，東字新圩田10畝，弓字號東亭頭田7畝6分;還有東莊田3畝;小黃灣田17畝和富莊田等。惲氏大宗祠范圍之廣，規模之大，祠田之多可謂甲于一鄉，祠載武進縣志。之后由于惲氏子孫經理有方，祠產漸豐，式廓屢增，改寑室前廂為二廡，大廳后建有亭，前垣東南角建有坊，正廳匾額為《光裕堂》，亭額為《鄱陽世澤》，可謂旗匾森森，儀威赫赫，一時稱美。由于祠產日益增多，至雍正朝，惲氏子孫恐日后產生弊病，族人于是制訂了一系列祠堂規約條款，呈邑侯趙公懇為勒石，使惲氏子孫自我約束，若有侵占祠廟利益，或不守條規，嚴重者送官究治或革逐出祠。

　　惲氏宗祠前有進士樓即魁星樓，為明朝東麓公之故跡。東麓公諱巍，惲氏五十六世孫，明弘治乙卯(1495年)舉人，壬戌(1502年)進士，由戶部主事遷刑部員外郎，功遷湖廣按察使副使，封承德郎。進士樓原為進士坊，因進士坊坍塌，于乾隆戊子年(1768年)，在松齡公主持下，族人鳩工庀材，改建進士樓，匾額一新，更為惲氏宗祠增添光彩。

　　道光壬寅年(1842年)，惲氏宗祠第五重樓毀于火，屢議改建平房而未成。咸豐庚申年(1860年)，惲氏宗祠遭洪楊之亂，盡成瓦礫。所存惟大門五楹及魁星樓，內外裝束全無，甚至墻壁間之柱也挖走無存。同治丁卯(1867年)冬，族人以兩年田租所入余錢四十八千購柱四梁五架于寑室舊基欲重建惲氏宗祠。由于經費不足，即發動族人量力解囊，并每丁歲捐五百，惲氏六十六世孫次山公，六十七世孫雨亭公、小山公，六十八世孫畹香公、思贊公捐巨款，先建正寢五楹，又建兩廡各三楹。光緒壬午(1882年)七月又籌集千金增建內寢三楹，夾道二夾，外各一楹，中楹祀前正寢，始祖祖妣、四十四世方直公祖妣及四十五世北分祖紹恩公、南分祖繼恩公祖妣，左楹祀前左廡各祖祖妣，右廡祀前右廡各祖祖妣，夾道北之一楹祀節孝、貞烈各女祖，夾道南之一楹祀各捐設女祖。至此，惲氏男女各祖均有奉祀，體現父之教，母之育，猶天地之同復載，日月之并照臨，祠田亦達二百一十二畝。

　　宗祠已復建，進士樓亦不能緩。光緒戊寅(1878)年，由族人仍按丁集捐，甫原公捐二百金，小山公、伯方公、次遠公、莘耘公及思贊公亦捐款，建成進士樓三楹，又北一楹為花廳，南一楹為賬房廳，前左右為長廊，右廊南建平屋一楹，依舊制開南向便門，原惲氏宗祠大門及魁星樓上下各一楹加以修葺，是時惲氏宗祠雖不如前之宏大，卻亦不失蔚為壯觀!

　　惲氏宗祠正寢供設始祖貞道公，左列北分祖紹恩公為昭，右列南分祖繼恩公為穆，其余供設祖考、祖妣如下：

　　正寢

　　左廡　中龕　祀科第31位

　　東龕　祀封翁30位

　　西龕　祀議敘17位

　　右廡　中龕　祀總支祖、分支祖57位

　　西龕　祀61-66世敬捐者62位

　　東龕　祀67-70世敬捐者59位

　　民國己丑年續進牌位

　　科第6位

　　封翁3位

　　議敘4位

　　敬捐41位

　　北楹　祀有功于祠者9位

　　南楹　祀有功于祠者9位

　　內寢

　　中楹、祀始祖祖妣，南北分始祖祖妣5位

　　中左楹　祀科第德配44位

　　東首　祀封翁德配43位

　　西首　祀議敘德配14位

　　中右楹　祀各支祖德配50位

　　北楹　祀壸德、節孝28位

　　南楹　祀壸德、節孝18位

　　一九四九年十月，中華人民共和國成立，在惲氏宗祠內開設孟城中心小學。據一九八五年出版的武進《孟城鄉志》載：“惲氏大宗祠，今為孟城中心小學校舍。現存硬山式祠屋四進各五楹。所用木材極粗大。三進前左右廡各三楹。共有祠屋二十六楹。除大門外，其余均為明末清初建筑。頭進為大門，南向。二進為大廳，名‘光裕堂’。三進為正寢，祀惲氏始祖等。四進為內寢，祀女祖。祠之東南隅原建大石坊，額書‘鄱陽世澤’四字，今坊柱殘石猶存。”一九八七年，孟城中心小學異地搬遷，原地設孟城鄉衛生院，后又改名為孟城中醫院，二○○四年，孟河鎮與小河鎮合并為孟河鎮，鎮政府設于小河鎮，孟城中醫院也作為鎮醫院設于小河。原地變為孟城衛生院，即社區醫院。原惲氏宗祠房屋在改造衛生院時已全部拆除，蕩然無存，但它為發展地方教育、衛生事業已作出了貢獻。

　　惲氏宗祠除孟城惲氏大宗祠外，還有許多分祠、支祠，如北分有克讓公分祠、石橋灣祠堂、方顯公支祠、東河巷西分祠、東莊祠堂、東亭學元公分祠、東河巷拙庵公祠堂、孟城北閘分祠、唐家村思義公祠堂等;南分有上店惲氏宗祠、西堰分富二公祠堂、常州迎春橋祠堂、居易公祠堂、飛伯公祠堂、味辛公祠堂、壽山村上店二分分祠、西園公祠堂、上店三分分祠、寺塘仲琰公祠堂、上店二分幼育公祠堂、貴一洋塸分祠堂、耕方公支祠、中丞公家廟等，現僅存上店惲氏宗祠部分遺跡。

　　上店惲氏宗祠

　　上店惲氏宗祠始建于明嘉靖年間，由惲氏五十八世孫南陽公(諱訓、字廷學)倡建。惲氏始祖貞道公諱子冬世居武進孟河之濱，傳四十四世至宋提舉方直公，方直公生子二，長曰紹恩世居孟河，次曰繼恩別業徙居武進上店，自此稱為南北分。惲氏興于宋且盛于宋，至明嘉靖已有幾百人，“科第仕宦踵相接，久為郡中望族”。惲氏五十六世孫二菊公諱禧誥贈奉直大夫，南京戶部員外郎;五十七世孫后溪公諱釜字器之，正德庚午舉人，辛巳進士，歷任四川成都府知府，誥封中憲大夫;五十八世孫南陽公封刑部主事;守溪公諱誥字廷恩，任河南許州判官;五十九世孫少南公諱紹芳字光世，嘉靖辛卯舉人，丁未進士二甲第三名，仕至福建左恭議，累贈通議大夫，湖廣按察使。按明朝時的規定，凡徙而起家者都應該為始遷祖建立宗祠，且三品以上官員必須立廟，一般老百姓在宗祠中祭祀三代，卿大夫在宗祠中祭祀四代，以報答祖宗之恩，且盡子孫孝敬之道。可以說，上店惲氏宗祠是應運而生。

　　上店惲氏宗祠，約于公元1550年前后，首建于上店鎮南，但建成不久即遭到戰爭的破壞。“寢室廊廡咸為所焚，惟神主龕櫝圖譜祭器宛然具存，燎原之勢幾及而止”。南陽公看到自己辛辛苦苦建成的宗祠毀于一旦，感到非常悲愴，惶惶不可終日。于是竭盡全力，再次籌集資金，不到半年功夫，宗祠又得以建成。當時祠址朝北向，表示惲氏祖先在北方，中堂匾額為“追遠堂”，表示永遠思念先祖，中堂之后為正寢安放祖宗先靈，中堂的前屏寫有“惲氏宗祠”，宗祠的中門匾額謂“本仁堂”，表示教育廣大族人做到孝敬、慈愛，中門的左邊堆放祠堂的糧食用來救濟貧困族人，右邊作為管理祠堂族人的寢室，祠堂后邊還有“望云樓”和“耕讀所”，作為族人讀書求取仕進之處，祠堂外面建有牌坊，上刻“番陽惲氏宗祠”六字，內外均按當時禮制設置。同時，南陽公獨捐義田(亦稱義莊)一百五十畝，作為宗祠日常費用、族人婚喪嫁娶的資助、鰥寡孤獨的救助，六十歲以上老人的口糧補助以及族人讀書求仕途的盤費和獎勵。由此可見，當時上店惲氏宗祠規模之大、祠田之多，建筑之雄偉。為防止宗祠日后“為豪右所侵，為不肖者所廢，乃獻數于郡邑之大夫，請給祠券，將聞之監司祠部，乞為上請，賜以祠額”，使宗祠以后能更加興旺。

　　嘉靖四十三年甲子(1564)，南陽公卒，又經過十五年萬歷己卯(1579)，南陽公長子少南公亦去世，祠產由少南公次子學思公管理。當時人多事繁，義田不能滿足祖先原來規定的資助標準，這個時候族人就以刻減祖制的名義把學思公告到郡有司，官司的起因是因為向佃戶收租而結下怨仇。經有司查明，義田本來是學思公的祖先一人獨捐，學思公認為祖先捐產本來是一件好事，結果反目為仇，就請求有司廢除義田，只留三十畝田作為宗祠奉祀祖宗的費用。故義田之廢為明萬歷年間之事。

　　明末清初，上店惲氏宗祠再次遭到戰爭的破壞，耕讀所南陽館池亦“悉為煨燼”，只剩下“余所四楹，門塾三楹，門外世科坊但存兩石柱而已”。 膴原公(諱厥初，字伯生，萬歷甲辰進士，授行人司行人，歷任陜西布政使，升光祿寺卿)和遜庵公(諱日初，字仲升，由庠生入太學，崇禎癸酉副榜)在無可奈何之際，把上店鎮南幾間小屋稍加修葺。作為宗祠，僅奉祀上店大分始祖敬齋公(諱鎡)、南陽公及少南公三人而已，由于神龕前板有刻字“孫男訓立”，故人們習慣稱為“南陽公祠”，此應為清雍正年間之事。

　　直至清乾隆年間，近百年時間，惲氏南分沒有自己的宗祠，此時惲氏南分已有八個分支。始遷祖宗祠未建，各分支亦不能建造自己的分祠，上店二分毅庭公(諱朝樽，字尊三)，就與本支族人商議共同捐款建造上店惲氏宗祠，上店四分亦積極響應。祠址由上店鎮南遷至上店鎮北，與橋北村上店四分宗祠相鄰。宗祠建成于乾隆己卯(1759)年，約費三百金。越二十年，乾隆己亥(1779)年，又增造前廗正寢，將惲氏南分始遷祖及各支之祖供奉其中，這是上店惲氏宗祠的第三次建造。經過五十年的風風雨雨。祠宇難免會有所損壞，嘉慶戊辰(1808)年至己巳(1809)年，上店二分、四分又商量，把宗祠進行了一次大的維修，使宗祠煥然一新。

　　咸豐庚申(1860)年，粵匪攻克常州，上店亦遭兵燹，上店惲氏宗祠被毀“蕩然無存”。同治甲子(1864)年，常州收復。同治丙寅(1866)畹薌公(諱光業，歷任江都縣丞，安徽靈壁縣知縣加知府銜，安徽候補道加布政使銜，覃恩一品封典榮祿大夫，浙江督理糧儲道，誥贈兵部尚書銜)辭官回鄉，慨然以重建宗祠為己任，自己首先捐款，凡是南分惲氏族人也都踴躍參與，但是所集資金還不夠建造之用。光緒丁丑(1877)年，鴻儀公(字伯方，號曼云，道光庚戌進士，翰林院庶吉士，歷任貴陽府、思南府知府)從貴州退休回鄉，戊寅(1868)年，心耘公(諱祖祁，號萊叟，歷任湖南零陵縣知縣，補用道候補知府，兩江總督、湖廣總督等，賞加二品頂戴)從湖南回鄉休養，大家再次商量要把惲氏宗祠重新建造起來。考慮到原來祠基不夠寬敞，而原址又與四分宗祠相鄰，上店四分子孫自愿把本分基地捐入宗祠，這樣宗祠的地勢就開闊了，同時造價也相應增加了。心耘公悉心籌劃，并先墊巨資，于光緒癸未(1883)年二月初二日動工，甲申(1884)年八月十六日落成，歷時一年半，第四次建成上店惲氏宗祠，規模比乾隆年所造宗祠有所擴大，堂匾為“世濟堂”。考慮到上店四分深明大義，自己分祠尚未興建，就把惲氏宗祠后廗最西邊一間讓給四分作為支祠。南分惲氏宗祠共耗錢四千三百三十二緡，首先倡議者畹薌公，通力合作者南分各尊長，獨任其難力籌巨資者心耘公，監督管理工程者子振公、子明公，鳩工庀材銷算核實者硯圃公，這些有功于宗祠建設者具詳載譜中。

　　上店惲氏宗祠在光緒年間共有祠田近四十畝，且祠內亦有許多資產，為使宗祠能綿延永久，不致因經理不力、管理不善，甚至侵蝕肥己，使祖宗遺產無故喪失，經族中討論推舉八人共同管理，每年有二人經手帳目，到冬至祭日將一年出入帳目并田產、存款交下一年二人接受清楚，其余人參與稽查，并抄寫細帳貼于宗祠墻壁公示，以便族人監督。

　　一九二三年，當地熱心教育人士創辦務本小學，校舍設于惲氏宗祠內，一九二六年更名為上店初級小學，開設二個班級，一九二九年秋，上店小學遷入胥城龍潭庵。一九四九年，上店 鄉人民政府集資創辦武南中學，由華東新閘出版局局長，上海日報社社長惲逸群題寫校名。一九五○年，上店惲氏宗祠作為武南中學校舍。一九五六年，私立武南中學改為公辦上店中學，之后“武進縣上店初級中學”、“武進縣上店中學”幾易其名，學校在惲氏宗祠原有房屋的基礎上，又增建校舍，增加教學設備，學校規模最多時十個班級，五百名學生。一九九七年，教育資源優化重組，上店初級中學隨之撤銷并入馬杭中學和廟橋中學。一九九九年馬杭鎮政府將上店中學校舍賣給元恒電子元件廠，二○○三年，為擴建廠房，元恒電子元件廠將惲氏宗祠第二、第三廗拆除，現僅存前廗五楹和邊房二間。